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Sur le même principe que le SKIM, il s'agit de la fonction principale assurée par le PROTOS. L'ensemble des matières en suspension, jusqu'aux micro-organismes (bactéries ...) se retrouve piégé par les microbulles formées par l'échange air-eau. Le PROTOS s'impose aujourd'hui sur le marché comme une alternative pour les petites structures ne pouvant pas accueillir le SKIM.

Un bassin de stockage de produits n'est viable que si plusieurs paramètres sont réunis. Parmi eux, l'oxygénation est fondamentale. Cette fonction est assurée par le PROTOS et découle directement du microbullage apportant une dissolution optimale de l'oxygène dans l'eau. Si cela s'avère necessaire le PROTOS peut être associé à des oxygénateurs relais type FORCE 7 ou SPLASH

La nouveauté amenée par le PROTOS est sa mise en place hors bassin. Contrairement au SKIM,, celui-ci n'est pas directement immergé et offre donc la possibilité par un réseau hydraulique adapté de connecter le traitement à différents bassins.