Sur le même principe que le SKIM, il s'agit de la fonction principale assurée par le PROTOS. L'ensemble des matières en suspension, jusqu'aux micro-organismes (bactéries ...) se retrouve piégé par les microbulles formées par l'échange air-eau. Le PROTOS s'impose aujourd'hui sur le marché comme une alternative pour les petites structures ne pouvant pas accueillir le SKIM.
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